現代農業生產中，用到米質判定儀的地方越來越多。其中就有育種專家利用它分析研究，并培育出了良好特性的品種。過去，在糧食危機和人們生活水平日益增長的雙重壓力下，培育高產優質超級水稻新品種成了育種專家長期奮斗目標，但那時并沒有像米質判定儀提供技術在支撐，傳統育種變得緩慢。如今，隨著農業信息化的不斷發展，很多種子檢驗儀器被人們所認識。

    通過米質判定儀，研究人員以高產但綜合品質差的品種“特青”作為受體，以蒸煮和外觀品質具有良好特性的品種“日本晴”和“93-11”為供體，對涉及水稻產量、稻米外觀品質、蒸煮食味品質和生態適應性的28個目標基因進行優化組合。這些優異的“品種設計”材料，在高產的基礎上，稻米外觀品質、蒸煮食味品質、口感和風味都有了很大程度的提升，并且與其配組的雜交稻稻米品質也有了明顯改良。此項研究結果必將掀起作物傳統育種向高效、精準、定向的分子設計育種轉變的狂潮。這也進一步證明了米質判定儀在育種工作中的重要應用。
    因為大米外觀是最直觀的大米特征，從大米的外觀上也常常能夠看出大米內在的一些變化，所以將大米外觀列為大米品質檢測的一項重要內容是有科學道理的，應用米質判定儀，就能有效避免堊白率、碎米率高，含有未熟粒、病斑粒和霉變粒的大米流向市場，保證消費者健康。